- GenerateAllSuboptimalStructures()
: RNA
- get_dGIndex()
: Multilign_object
- get_energies()
: Multilign_object
- get_gap()
: Multifind_object
- get_pair_alignments()
: Multilign_object
- GetBackboneType()
: RNA
- GetBestPairEnergy()
: Dynalign_object
- GetBreakTargetDG()
: Oligowalk_object
- GetCommentString()
: RNA
- GetDat()
: Thermodynamics
- GetDatatable()
: Thermodynamics
- GetDefect()
: design
- GetDuplexDG()
: Oligowalk_object
- GetEnergyRead()
: Thermodynamics
- GetEnsembleEnergy()
: RNA
- GetEnthalpyTable()
: Thermodynamics
- GetErrorCode()
: HybridRNA
, Multilign_object
, RNA
, TwoRNA
- GetErrorMessage()
: Dynalign_object
, HybridRNA
, Multilign_object
, Oligowalk_object
, RNA
, TwoRNA
- GetErrorMessageString()
: RNA
, TwoRNA
- GetForbidIntramolecular()
: HybridRNA
- GetForcedAlignment()
: Dynalign_object
- GetForcedDoubleStranded()
: RNA
- GetForcedFMNCleavage()
: RNA
- GetForcedModification()
: RNA
- GetForcedPair()
: RNA
- GetForcedProhibitedPair()
: RNA
- GetForcedSingleStranded()
: RNA
- GetFreeEnergy()
: RNA
- GetIndexSeq()
: Multilign_object
- GetInputFilenames()
: Multilign_object
- GetIterations()
: Multilign_object
- GetLabelXCoordinate()
: RNA
- GetLabelYCoordinate()
: RNA
- GetLowestEnergy()
: Dynalign_object
- GetMaxDsv()
: Multilign_object
- GetMaximumPairingDistance()
: RNA
- GetMaxPairs()
: Multilign_object
- GetNucleotide()
: RNA
- GetNucleotideXCoordinate()
: RNA
- GetNucleotideYCoordinate()
: RNA
- GetNucType()
: Multilign_object
- GetNumberOfForcedDoubleStranded()
: RNA
- GetNumberOfForcedFMNCleavages()
: RNA
- GetNumberOfForcedModifications()
: RNA
- GetNumberOfForcedPairs()
: RNA
- GetNumberOfForcedProhibitedPairs()
: RNA
- GetNumberOfForcedSingleStranded()
: RNA
- GetOligoOligoDG()
: Oligowalk_object
- GetOligoSelfDG()
: Oligowalk_object
- GetOverallDG()
: Oligowalk_object
- GetPair()
: RNA
- GetPairEnergy()
: RNA
- GetPairProbability()
: RNA
- GetPairs()
: Multilign_object
- GetProgress()
: Multilign_object
, RNA
- GetRNA1()
: TwoRNA
, HybridRNA
- GetRNA2()
: HybridRNA
, TwoRNA
- GetSequenceLength()
: RNA
- GetSequenceNumber()
: Multilign_object
- GetSHAPEIntercept()
: Multilign_object
- GetSHAPESlope()
: Multilign_object
- GetStructure()
: RNA
- GetStructureNumber()
: RNA
- GetTemperature()
: TwoRNA
, Thermodynamics
, Multilign_object
- GetTm()
: Oligowalk_object
Generated on Wed Sep 2 14:36:50 2015 for RNAstructure Classes by
1.5.7.1