RNAstructure Classes
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Class List
Class Hierarchy
Class Members
All
Functions
Variables
Typedefs
a
b
c
d
e
f
g
h
i
l
m
n
o
p
r
s
t
v
w
~
- g -
GenerateAllSuboptimalStructures() :
RNA
get_dGIndex() :
Multilign_object
get_energies() :
Multilign_object
get_gap() :
Multifind_object
get_pair_alignments() :
Multilign_object
GetAlphabetName() :
Thermodynamics
GetBackboneType() :
RNA
GetBestPairEnergy() :
Dynalign_object
GetBreakTargetDG() :
Oligowalk_object
GetCommentString() :
RNA
GetDatatable() :
Thermodynamics
GetDefect() :
design
GetDuplexDG() :
Oligowalk_object
GetEnergyRead() :
Thermodynamics
GetEnsembleDefect() :
RNA
GetEnsembleEnergy() :
RNA
GetEnthalpyTable() :
Thermodynamics
GetErrorCode() :
HybridRNA
,
Multilign_object
,
RNA
,
TwoRNA
GetErrorDetails() :
Multilign_object
,
RNA
,
TwoRNA
GetErrorMessage() :
Dynalign_object
,
HybridRNA
,
Multilign_object
,
Oligowalk_object
,
RNA
,
RsampleData
,
TwoRNA
GetErrorMessageString() :
RNA
,
TwoRNA
GetForbidIntramolecular() :
HybridRNA
GetForcedAlignment() :
Dynalign_object
GetForcedDoubleStranded() :
RNA
GetForcedFMNCleavage() :
RNA
GetForcedModification() :
RNA
GetForcedPair() :
RNA
GetForcedProhibitedPair() :
RNA
GetForcedSingleStranded() :
RNA
GetFreeEnergy() :
RNA
GetFullErrorMessage() :
RNA
GetIndexSeq() :
Multilign_object
GetInputFilenames() :
Multilign_object
GetIterations() :
Multilign_object
GetLabelXCoordinate() :
RNA
GetLabelYCoordinate() :
RNA
GetLowestEnergy() :
Dynalign_object
GetMaxDsv() :
Multilign_object
GetMaximumPairingDistance() :
RNA
GetMaxPairs() :
Multilign_object
GetNucleotide() :
RNA
GetNucleotideXCoordinate() :
RNA
GetNucleotideYCoordinate() :
RNA
GetNucType() :
Multilign_object
GetNumberOfForcedDoubleStranded() :
RNA
GetNumberOfForcedFMNCleavages() :
RNA
GetNumberOfForcedModifications() :
RNA
GetNumberOfForcedPairs() :
RNA
GetNumberOfForcedProhibitedPairs() :
RNA
GetNumberOfForcedSingleStranded() :
RNA
GetOligoOligoDG() :
Oligowalk_object
GetOligoSelfDG() :
Oligowalk_object
GetOverallDG() :
Oligowalk_object
GetPair() :
RNA
GetPairEnergy() :
RNA
GetPairProbabilities() :
RNA
GetPairProbability() :
RNA
GetPairs() :
Multilign_object
GetProgress() :
Multilign_object
,
RNA
GetRNA1() :
HybridRNA
,
TwoRNA
GetRNA2() :
HybridRNA
,
TwoRNA
GetSequence() :
RNA
GetSequenceLength() :
RNA
GetSequenceNumber() :
Multilign_object
GetSHAPEIntercept() :
Multilign_object
GetSHAPESlope() :
Multilign_object
GetStructure() :
RNA
GetStructureNumber() :
RNA
GetTemperature() :
Multilign_object
,
Thermodynamics
,
TwoRNA
GetTm() :
Oligowalk_object
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